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[建议讨论] pubmed主要有哪个检索方法(PubMed只会简单检索这5)

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发表于 2024-3-21 00:31:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
文献检索网站千千万,萝卜青菜各有所爱。
  
        在众多网站中,Pubmed 想必是大多数人步入科研时接触的第一个文献检索网站。它是由美国医学图书馆(NLM)开发,可提供免费的题录、摘要和部分全文,是目前最常用的英文数据库。
  
        对于文献检索,个人觉得最重要的就是——用最短的时间,找到你想要的文章。
  
        但是,说起来容易,做的难。单一关键词的检索还能轻松 handle,一旦遇到多个字段的检索就束手无策,要么查不全漏掉关键文章,要么查得范围太大导致文章成千上万。
  
        今天就带领大家轻松解锁 pubmed 检索文献的 5 种优雅姿势!
  
        Pubmed 官网
  
        官网指路:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
  
        正所谓「磨刀不误砍柴工」,首先登陆 Pubmed 官网首页,熟悉一下常用的以及我们需要使用的功能。
  
       


  
        上图红框显示的是不同数据资源库,如 PubMed、GEO Datasets 等,十分便捷的提供了多种外部链接数据库,方便用户使用。
  
        蓝框显示的是快速检索栏(或称为简单检索),如我们想搜索肺癌的相关文章,输入 lung cancer 这个关键词后点击 search 即可。
  
        绿框(「Advance」)显示的是高级检索。
  
        右上角橙框显示的是账号登陆,有 Goolge 邮箱的小伙伴建议去注册个 NCBI 的账号,有账号就可以保存你的检索式,设置你的筛选条件等!
  
        红色箭头所示的为 Mesh 数据库。蓝色箭头所示的为临床资料查询。
  
        至于高级检索、Mesh 数据库、临床资料查询会在下面详细讲解与演示,各位看官不要心急,好戏在后头!
  
        下面我们就以「erlotinib 治疗肺癌」为检索主题演示 5 种检索方法!
  
        1. 快速检索(推荐指数:4 颗星)
  
       


  
        首先在快速检索栏输入「lung cancer,erlotinib 」点击 search。
  
       


  
        大家可以看到,检索出来的文章有 4061 篇。左侧红框可根据文章类型,发表时间等对检索结果进行进一步筛选,点击「show additional filters」还可根据额外的条件进行筛选,如年龄、性别等。
  
        2. 还是快速检索(推荐指数:4 颗星)
  
        依旧是快速检索栏,我们现在给 lung cancer 和 erlotinib 分别加上引号进行检索,看看是否有不同。
  
       


  
       


  
        大家可以看到,检索结果变成了 3508 篇,少了 500 篇左右。为什么会不一样呢?
  
        在这里大家要明白的是,对于第一种输入方式,Pubmed 会先根据系统已有的词组进行查询,然后系统再根据 lung AND cancer AND erlotinib 进行检索。
  
        而像第二种方法,我们加了引号,就是告诉系统,按照「lung cancer」和「erlotinib」这两个词组进行检索,不是词组的我们就不要了。
  
        3. 高级检索(推荐指数:3 颗星)
  
        点击「Advance」进入高级检索界面。
  
       


  
        如上图所示,红框为检索显示栏,蓝框为检索式构建器,绿框为检索历史。
  
        黑框里的「All Fields」是供用户选择的检索条件,可以选择根据题目,题目与摘要,作者,杂志等条件进行检索,请看下图。
  
       


  
        选择 Title/Abstract(题目与摘要)进行检索,这也是最常选择的检索条件。
  
       


  
        大家可以看到,检索结果变成了 3191 篇。
  
        4. Clinical Queries(推荐指数:4 颗星)
  
        点击 Pubmed 首页的 Clinical Queries(临床资料查询),进入首页,输入 lung cancer,进入如下界面。
  
       


  
        红框里可以选择治疗、诊断、预后等文章,以及宽(窄)范围检索。蓝框显示的是相关的系统回顾以及 meta 分析文章,绿框里显示的根据某类基因(如诊断、管理等)进行筛选。非常适合要做基因方向的小伙伴哦!
  
        在每一列的下方都有个「See all」,因为我们只要看 lung cancer 的治疗,所以选择红框最下方的「See all」。
  
       


  
       


  
        然后在输入框中输入 erlotinib,得到以下结果。
  
       


  
        大家可以看到,检索结果变成了 2865 篇。
  
        5. Mesh 检索(推荐指数:5 颗星)
  
        说到检索,怎么能少得了 Mesh 检索大法呢?
  
        Mesh 检索即主题词检索,通俗地讲就是 NLM 编制了本主题词字典,然后我们根据标准化的主题词进行检索,既能提高查全率,还能提高查准率,五颗星实至名归。
  
        在 Pubmed 首页点击 Mesh Database 进入 Mesh 搜索首页。
  
       


  
        输入 lung cancer,点击 search。
  
       


  
        一般没有特殊的要求,都是选择第一个主题词,点击进入。
  
       


  
        因为我们想要的是治疗的文章,所以将 therapy 勾上,绿框所示的两个尽量一般不要勾选(除非有特殊需要),点击 Add to search builder,将第一个条目添加,然后就在这个界面的检索框里输入 erlotinib。
  
       


  
        将 therapeutic use 勾选,点击 Add to search builder,这样我们就将两个检索式设定好了。最后点击 search Pubmed。
  
       


  
        大家可以看到,检索结果变成了 486 篇了,仅是第 1 种检索方法的 1/10。
  
        Mesh 的检索方法准确度高,而且还可以根据需求选择治疗、预后、不良事件等限定条件,简直不要太好用。这也是我现在最常用的检索方式,强烈推荐!!!
  
        恭喜各位看官看完这篇文章,如果以前只会简单检索,那么这些方法,赶紧用起来,为自己的科研提供更多强有力的文献支持!
  
        最后用一张图给大家总结下这篇文章。
  
       


  
        来源于科研论文时间
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